В TheBat! Нужно выделить требуемые письма и экспортировать их в формат Unix Mailbox. Получившийся файл нужно скопировать в папку, в которой лежат письма Thunderbird (например для Portable-версии - ...\ThunderbirdPortable\Data\profile\Mail\Local Folders). В Thunderbird появится одноименная названию файла папка.

Внимание! В обычной версии файл profiles.ini содержит местоположения профилей.