Для того чтоб сменить рабочую группу из командной строки нужен специальный ехе-шник Netdom.exe из какого-то тулкита для win2000 (причем именно из 2000):

Команда следующая:
netdom.exe MEMBER \\my_computer /JOINWORKGROUP my_workgroup

ИЛИ

netdom.exe MEMBER /JOINWORKGROUP my_workgroup

Источник: http://forum.oszone.net/printthread-60212.html

Скачать файл Netdom.exe Вы можете в разделе "Файловый архив".